(1) Peptida antimikrob serangga: Serangga merupakan kumpulan organisma terbesar, dan bilangan peptida antimikrob yang mereka hasilkan adalah besar. Sehingga kini, lebih 200 jenis peptida antimikrob serangga telah dikenal pasti merentas lapan pesanan, termasuk Lepidoptera, Diptera, Coleoptera, dan Odonata; terutamanya, 40 gen peptida antimikrob telah diasingkan daripada ulat sutera (*Bombyx mori*) sahaja.
(2) Peptida antimikrob mamalia: Peptida antimikrobial mamalia Cecropin P1 pertama kali diasingkan daripada usus kecil babi pada tahun 1989. Pada masa ini, sekurang-kurangnya 18 jenis telah diasingkan daripada babi, 30 daripada biri-biri, dan 30 daripada lembu.
(3) Peptida antimikrob amfibia: Amfibia mempunyai kulit telanjang yang mempunyai pelbagai fungsi. Rembesan kulit mereka mengandungi pelbagai jenis peptida bioaktif dengan pelbagai aktiviti biologi; kebanyakannya mempamerkan sifat antimikrob. Mewakili bentuk pertahanan semula jadi yang kuno dan berkesan, ia biasanya dikelaskan sebagai peptida antimikrob.
(4) Peptida antimikrob daripada ikan, moluska dan krustasea: Pardaxin, 35-amino-asid-peptida sisa yang diasingkan daripada sol Moses (*Pardachirus marmoratus*) pada tahun 1986, ialah antimikrobial pertama daripada peptida amphipa peptida kepada ampaication ikan. -struktur heliks yang mampu meresap membran. Ia berfungsi sebagai neurotoksin ionik, dan satu siri peptida terbitan telah dibangunkan yang mempamerkan aktiviti antimikrob yang lebih kuat-dan aktiviti hemolitik yang lebih rendah-daripada melittin.
(5) Peptida antimikrob tumbuhan: Tumbuhan juga menghasilkan peptida antimikrob secara struktur serupa dengan defensin yang terdapat dalam serangga dan mamalia; ini dikenali sebagai defensin tumbuhan. Kebanyakan peptida antimikrobial tumbuhan sangat aktif terhadap patogen tumbuhan, walaupun sesetengahnya juga menunjukkan ketoksikan terhadap bakteria, kulat, yis dan sel mamalia Gram-positif dan Gram-negatif. Thionin adalah peptida antimikrob pertama yang diasingkan daripada tumbuhan.
(6) Peptida antimikrob bakteria: Juga dikenali sebagai bacteriocins, ini termasuk kedua-dua peptida kationik dan neutral dan dirembeskan oleh kedua-dua bakteria Gram-positif dan Gram-negatif. Empat jenis peptida antimikrobial telah dikenal pasti dalam bakteria: bacitracin, gramicidin S, polymyxin E, dan nisin.
